あらすじ
宇宙世紀0097年。『ラプラスの箱』が開放され、ニュータイプの存在とその権利を認める宇宙世紀憲章の原点が明らかになったにもかかわらず、世界は大きな変化を迎えることはなかった。ネオ・ジオン残党軍「袖付き」の壊滅により、『ラプラス事変』は終結したかに見えた。しかし、事変の最終決戦において、2機のフル・サイコフレーム搭載モビルスーツは、人類の想像をはるかに超える力を示した。白いユニコーンと黒い獅子と呼ばれたそれらの機体は、その圧倒的な力から人類にとって脅威と見なされ、人々の記憶から封印され、歴史の闇に葬り去られようとしていた。そのような中、2年前に消息を絶ったRX-0 ユニコーンガンダム3号機が、再び目撃されるようになる。その不死鳥のような金色の機体は、フェネクスと呼ばれていた。地球連邦軍をはじめとする各勢力がフェネクスの捕獲あるいは排除に動き出す中、その機体の存在を巡る秘密と、ニュータイプの真の可能性が再び注目を集め、宇宙世紀に新たな争いの火種を撒き散らす危険性をはらむ。この物語は、フェネクスを巡る争いを通じて、ニュータイプとは何か、人類の未来はどうあるべきかという問いを投げかける。