箱庭学園に転校してきた1年生の黒神めだかは、生徒会長に就任する。彼女は目安箱を設置し、生徒からのあらゆる要望や悩みに応えるべく、生徒会活動に全力を注ぐ。めだかはその超人的な能力と理想主義で、学園に巻き起こる様々な問題に立ち向かっていく。