『ロックマンゼロ』は、記憶を失ったレプリロイド、ゼロの物語である。彼は臆病な性格になっていたが、新たな友人であるリトと共に、自身の過去を取り戻すための旅に出る。その道中で、ゼロは自身の過去に深く関わる新たな敵たちと対峙することになる。
