『ボクのアイドル』は、生徒会が学校の文化祭にアイドルパフォーマンスを取り入れることを決定したことから始まる物語である。主人公の平野春文は、この企画のために女子生徒の中からアイドルグループを結成し、育成するという任務を任される。