「魔法の山」は、父親の死と母親の入院という不幸に見舞われた少年、健一の物語である。彼は妹とともに祖父母の家で夏を過ごすことになる。この期間を通じて、健一は両親に対する複雑な感情と向き合い、自身の心に秘められた本当の願いを発見していく。