「花君と恋する私」は、学級委員長の坂下菜々と、不登校気味の同級生である花君の交流を描く物語である。ある出来事をきっかけに、二人の間には予想外の友情が芽生える。菜々は花君を学校へ通わせようと努力し、花君もまた、菜々との関係を深めようと試みる。