異次元からの侵略者「ネイバー」が地球を襲い、既存の兵器では対抗できない状況に陥る。人類は、ネイバーの技術を応用した新たな兵器を開発し、その兵器を扱う組織「ボーダー」を設立して、地球を守るための戦いを繰り広げる。