「少年の境界」は、幼なじみのユカとカオルの関係性を描いた物語である。おとなしく静かなカオルに対し、中学校に入ってからユカは彼を避けるようになる。しかし、身体測定の時期が訪れると、二人の生活は予期せぬ変化を遂げ始める。