謎の飛翔体「ザイ」が突如として出現した世界で、人類は「ドーター」と呼ばれる戦闘機と、人間の少女の姿をした自動戦闘機構「アニマ」を開発する。物語は、空を飛ぶことを夢見る少年、鳴谷慧を中心に展開し、彼とアニマたちの交流や戦いを描く。
