防衛省のスパイであるA4は、「ファントム」の異名を持つほどの卓越した能力で、日本の安全を陰から守ることに尽力している。そんな彼が、並外れた身体能力を持ち、彼に恋心を抱く女子高生・甲斐マミルと出会うことで、様々な誤解が生じていく。
