カムイ外伝は、抜け忍として追われる身のカムイが主人公の物語である。彼は逃亡生活の中で漁師の家族と出会い、彼らとの間に友情を育んでいく。しかし、その平穏な日々も長くは続かず、カムイを追う敵対する忍者たちとの戦いが繰り広げられる。
