現代の日本には、政府機関として「怪異戸籍課」が存在する。この部署の役割は、戸籍を持たない未登録の妖怪たちを支援することだ。ムツコは怪異戸籍課の職員として、適切な登録がなく困っている妖怪たちのために日々奔走している。