つがい巫女の虹結びは、特別な神社で舞台に立つことを夢見てきた真祖歩が、巫女たちの精神的な故郷であるその場所で、ついに観客の前で舞を披露する機会を得る物語である。彼女は選ばれし巫女として、伝統と期待を背負い、その才能を開花させていく。