広大な都市型学園「ユーカリの葉学園」に入学した猫田雄一は、学園の謎を解き明かそうとする有咲千歳と出会う。二人は意気投合し、「放課後ひみつクラブ」を結成。学園に隠された真実を追い求める、学園ミステリーである。
