呼吸のあいだに恋になるは、友人である恵から「友達以上の関係になろう」と提案された直也が、その言葉に戸惑いながらも自身の感情と向き合う青春ラブストーリーである。長年の友情から芽生える新たな関係に、直也はどのような答えを出すのか。