「いたいのはこころです」は、静かな住宅街を舞台にした人間ドラマである。英語教師の千野は、妊娠中の妻と穏やかな日々を送っていた。しかし、教え子のヤコが自宅を訪れたことをきっかけに、千野の心に変化が訪れる。