『化学室へどうぞ』は、化学教師の芝浦と生徒の浩介の関係を描く物語である。普段は穏やかな芝浦だが、内には秘めた情熱を抱えており、浩介はその意外な一面に強く惹かれている。二人の禁断の恋が、化学室を舞台に展開される。